元朝政府在西藏设立乌斯、藏、纳里速古鲁孙等三路宣慰使司都元帅府，有都元帅、宣抚、安抚、招讨等使。
乌斯即前藏，藏即后藏，纳里速古鲁孙即阿里三部。
当时把前后藏分为13个万户，万户长以上的官吏由中央直接任命。
此外，还在西藏设置驿站，调查户口，征收赋税，屯戌军队。
总之，从元朝开始，西藏地区已正式成为我国中央政府直接管辖的一个地方行政区域。
元世祖即位后，在云南设置了行省。
行省之下，还设置了路、府、州、县。
又设置若干军民总管府。
元世祖派回回人赛典赤赡思丁为第一任云南行省的最高长官“平章政事”
。
此后云南和内地的联系也更加密切。
元代，祖国大陆与台湾之间的政治关系有了新的发展。
至元时，在澎湖设立巡检司，“隶泉州晋江县”
。
元朝通过澎湖巡检司管辖澎湖与台湾。
这是中国政府在台湾地区正式建立的行政权力机构。
大一统元朝大统一的政治形势，促进了边疆各族和中原地区经济、文化联系的发展；各民族联系的加强，又巩固了空前统一的国家。
由于当时大量汉族被签发到边地去开垦，边疆各族也大量迁入内地定居，宋、辽、西夏、金时期各少数民族偏守一隅的情况逐渐有了变化，相互间开始加强了沟通和联系。
过去视为边陲绝域的地区都和中原成为同呼吸共命运的整体。
原有的地域观念逐渐减弱。
元朝是我国统一多民族国家形成的重要阶段。
中国的回族，就是在这个时期开始形成的。
在元代“回回”
一词最初是指由中亚、阿拉伯、波斯等地迁到中国的人。
经过长期在内地与其他各族杂居，彼此互通婚姻，文化上互相渗透，逐渐在中国境内形成了具有独特生活习惯、宗教信仰、文化特点的新民族——回族。
回族的形成，说明元朝时期中国民族融合已发展到了一个新的阶段。
设立驿站元代的驿站制度，在窝阔台汗时代就具备了雏形。
随着蒙古疆土的扩大，特别是征服了欧亚广大地区之后，日益显示出这个制度对巩固统一的重要作用。
后来不断有革新和整顿。
元世祖定都大都后，驿站制度就在一个更大的规模上发展起来，以大都为中心修筑了四通八达的驿道，在全国交通线上设置了站赤（蒙语音译，意为管理驿站的人），以便“通达边情，布宣号令”
。
在当时，蒙古地区的驿站，专设通政院管辖；中原地区的驿站，则归兵部掌管。
站赤分陆站和水站。
陆站用马、牛、驴或车，辽东有些地方运输时用狗拉橇行于泥雪上，故又有狗站。
水站则用船。
据记载，全国站赤共有1400处，这个数字还不包括边远地区和四大汗国间的驿站。
和驿站相铺而行，专用以传递紧急文书的机构叫急递铺。
每10里或15里、25里设一铺，每铺置铺丁五人。
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