进入印度一个月后，由于超负荷手术和严重的高山病，欧阳昏倒在手术台上，血压200多，心脏也大了，吃不下饭，身体彻底垮了。
随着反击战的胜利，部队开始撤军，战友们用担架抬着他，又翻过喜马拉雅山脉回到祖国。
主政北京协和
严重的高山病使欧阳不能继续在高原工作，被调回了内地。
那几年他在北京组建了315医院（现二炮总医院），曾任总参管理局卫生处长，山西省军区副司令。
1973年被调到成都军区后勤部司令部任党委书记兼副参谋长，分管机要、通讯工作。
粉碎&ldo;四人帮&rdo;后的1978年百废待兴，当时的总书记胡耀邦到四川检查工作，从人堆里发现了欧阳。
解放战争时胡耀邦在18兵团，是欧阳的老上级了，重逢自然倍感亲切。
当胡耀邦得知&ldo;小欧阳&rdo;在成都军区正干着与业务毫不相干的工作，非常生气地说:&ldo;这不是诸葛亮耍大刀‐‐不务正业嘛!你给我回北京整顿医院去。
&rdo;于是钱信忠（卫生部长）通过总政下调令，1979年欧阳被调回北京任协和医院院长。
这在当时算是高职低配，但欧阳还是欣然接受了组织的安排。
协和医院解放前由美国洛克菲勒基金会创办，尽管解放后已收归国有，但在&ldo;文化大革命&rdo;中为了在政治上与帝国主义彻底划清界线，被改成了首都医院。
在那个是非颠倒、人妖不分的年代，专家学者被迫靠边站，党委书记带头抗拒卫生部的指示;年轻的医护人员不钻研业务，有的好吃懒做，游手好闲;病房无人管理，病人东一个西一个四处游荡;医疗技术全面滑坡，管理一片混乱。
欧阳刚到医院，有一个病人因精神错乱跳了楼，欧阳让党委书记去看一下，正在打扑克的书记连头也不抬地说:&ldo;这是经常的事，有什么看头!&rdo;
这哪还像个医院!遵照上级指示，欧阳进行了大刀阔斧的整顿。
首先报请卫生部撤换了那个没有责任心的党委书记;开除了一名无理取闹、藐视领导的护士。
在&ldo;文革&rdo;刚刚结束的时候，这样做是需要些勇气的。
这‐举动震惊全院，整个医院立刻安静下来。
有人悄悄打听这个新院长怎么那么&ldo;横&rdo;，知情人说，这个人不一般，老红军、野战外科专家，建国初协和医院就是他来接收的。
欧阳老人自己说，我的这些做法虽然过了点儿，但在当时的历史条件下，要压倒歪风邪气，非用这剂猛药不可。
欧阳是我军自己培养的野战外科专家，他深知自己的成长得益于战争实践，得益于白求恩、米勒、钱信忠等中外专家的培养。
协和医院要发展，必须尊重知识，依靠专家来治院，空喊政治口号治不了病!
原副院长、五官科专家张庆松因出身资本家，被罚去扫厕所。
欧阳让他立刻上班，恢复副院长职务。
过去许多专家、教授因挨整长期呆在家里，欧阳请他们重新上班，尊重他们的人格，支持他们的工作，许多人还委以重任，大家工作起来心情舒畅了。
在生活上，欧阳规定专家教授可以使用小汽车。
当时北京小汽车非常稀少，在长安街上都看不到几辆。
总务处提出来要增加车辆，欧阳说:&ldo;不用了，我的车拿出来给大家用。
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